Cómo encontrar diferencias entre dos cadenas en SQL

Ambas cadenas deben dividirse en sus partes. En SQL-Server 2008, es mejor hacerlo con un enfoque XML.

atención :si sus datos pueden incluir caracteres prohibidos como <>öä@€& y no solo caracteres latinos simples como en tu ejemplo, necesitarías un esfuerzo extra...

El resto es bastante fácil:solo tome todas las partes de @String1 que no se encuentran en @String2 .

El resultado concatenado es, nuevamente, mejor hacerlo a través de XML

Prueba esto:

Declare @String1 as varchar(100)='a,b,c,d,e';

Declare @String2 as varchar(100)='b,e';

WITH FirstStringSplit(S1) AS
(
    SELECT CAST('<x>' + REPLACE(@String1,',','</x><x>') + '</x>' AS XML)
)
,SecondStringSplit(S2) AS
(
    SELECT CAST('<x>' + REPLACE(@String2,',','</x><x>') + '</x>' AS XML)
)

SELECT STUFF(
(
    SELECT ',' + part1.value('.','nvarchar(max)')
    FROM FirstStringSplit
    CROSS APPLY S1.nodes('/x') AS A(part1)
    WHERE part1.value('.','nvarchar(max)') NOT IN(SELECT B.part2.value('.','nvarchar(max)')
                                                  FROM SecondStringSplit 
                                                  CROSS APPLY S2.nodes('/x') AS B(part2)
                                                  ) 
    FOR XML PATH('')

),1,1,'')