Los archivos enumerados en Project Properties > Publish > Application Files es compilado automáticamente por Visual Studio. Su aplicación debe requerir estas DLL. Si aún no están registrados en la máquina, configurándolos como excluded generará el error que describes.
Debe establecer los ensamblajes en Included o si esto agrega una sobrecarga de tamaño inaceptable a su distribución, puede ir a Project Properties > Publish > Prerequisites y agregue SQL Server 2012 Express LocalDB