Oracle SELECT TOP 10 registros

Deberá colocar su consulta actual en subconsulta como se muestra a continuación:

SELECT * FROM (
  SELECT DISTINCT 
  APP_ID, 
  NAME, 
  STORAGE_GB, 
  HISTORY_CREATED, 
  TO_CHAR(HISTORY_DATE, 'DD.MM.YYYY') AS HISTORY_DATE  
  FROM HISTORY WHERE 
    STORAGE_GB IS NOT NULL AND 
      APP_ID NOT IN (SELECT APP_ID FROM HISTORY WHERE TO_CHAR(HISTORY_DATE, 'DD.MM.YYYY') ='06.02.2009')
  ORDER BY STORAGE_GB DESC )
WHERE ROWNUM <= 10

Oracle aplica rownum al resultado después de que se haya devuelto.
Debe filtrar el resultado después de que se haya devuelto, por lo que se requiere una subconsulta. También puede usar la función RANK() para obtener resultados Top-N.

Para el rendimiento, intente usar NOT EXISTS en lugar de NOT IN . Vea esto para más.