¿Por qué el orden de clasificación de varchar de Oracle no coincide con el comportamiento de la comparación de varchar?

Pedro,

el comportamiento de la clasificación está regulado por NLS_SORT parámetro de sesión, mientras que el comportamiento de las comparaciones depende del NLS_COMP parámetro. Debes tener una discrepancia.

Obtengo el mismo resultado que tú con los siguientes parámetros:

SQL> SELECT *
  2    FROM nls_session_parameters
  3   WHERE parameter IN ('NLS_COMP', 'NLS_SORT');

PARAMETER                      VALUE
------------------------------ ----------------------------------------
NLS_SORT                       FRENCH
NLS_COMP                       BINARY

Sin embargo, cuando los dos coinciden, el resultado es consistente:

SQL> alter session set nls_comp=LINGUISTIC;

Session altered

SQL> select * from (
  2    select '000000000000' as x from dual
  3    union
  4    select '978123456789' as x from dual
  5    union
  6    select 'B002AACD0A' as x from dual
  7  ) /*where x>'000000000000'*/ order by x;

X
------------
B002AACD0A
000000000000
978123456789

SQL> select * from (
  2    select '000000000000' as x from dual
  3    union
  4    select '978123456789' as x from dual
  5    union
  6    select 'B002AACD0A' as x from dual
  7  ) where x > '000000000000' order by x;

X
------------
978123456789