Si aplica un hash al clob, puede usarlo en una subconsulta para tomar el ID de fila máximo para cada eventid_nbr con el mismo valor hash de clob. Luego, simplemente filtre su tabla de relación_dos en la cláusula where.
SELECT EVENTID_NBR, INPUT_ARGS
FROM RELATION_ONE, RELATION_TWO
WHERE RELATION_ONE.LOGID_NBR = RELATION_TWO.LOGID_NBR AND
EVENTID_NBR BETWEEN 143 AND 192 AND
EVENTID_NBR != 172 AND SYSDATE - 7 >= RELATION_ONE.LAST_UPDATED
AND (RELATION_TWO.EVENTID_NBR, RELATION_TWO.ROWID) IN
(SELECT DISTINCT EVENTID_NBR,
MAX(ROWID) OVER (PARTITION BY EVENTID_NBR, DBMS_HASH(INPUT_ARGS,3))
FROM RELATION_TWO);
El 3 en HASH especifica SHA, pero también puede usar MD4 (1) o MD5 (2) si lo desea.
Estoy pensando que esto podría ser muy lento si tiene muchas filas en la tabla RELATION_TWO y estoy seguro de que esto se puede escribir para que funcione mejor, pero el concepto es sólido.