Puede encontrar aquí la documentación de SQLAlchemy que analiza esto. Oracle no tiene una función de incremento automático y se basa en la secuencia para imitar el comportamiento.
Entonces, su columna de identificación debería verse así:
id_seq = Sequence('id_seq')
id = db.Column(db.Integer, id_seq,
server_default=id_seq.next_value(), primary_key=True)
