EDITAR: Primero verifique, si no se quedó sin espacio en disco, antes de resolver la resolución relacionada con la configuración.
Parece que tiene un tamaño máximo demasiado bajo para su innodb_data_file_path en tu my.cnf , En este ejemplo
innodb_data_file_path = ibdata1:10M:autoextend:max:512M
no puede alojar más de 512 MB de datos en todas las tablas de innodb combinadas.
Tal vez debería cambiar a un esquema innodb-per-table usando innodb_file_per_table .
