Debe agrupar por la columna interesante y para cada valor, seleccione el valor en sí y el número de filas en las que aparece.
Entonces es cuestión de ordenar (poner primero el valor más común) y limitar los resultados a una sola fila.
En forma de consulta:
SELECT column, COUNT(*) AS magnitude
FROM table
GROUP BY column
ORDER BY magnitude DESC
LIMIT 1