Según recuerdo, no hay diferencia. Pero compruébelo usted mismo si:
explain plan for
SELECT * FROM `table` WHERE `unix_date` BETWEEN 1291736700 AND 1291737300
y:
explain plan for
SELECT * FROM `table` WHERE `unix_date` >= 1291736700 AND `unix_date` <= 1291737300
producir los mismos planes.