No es un error. Es una advertencia que proviene de CONVERT() cuando le pide que convierta no numérico a entero;
Ejecute estas consultas en la consola para ver:
mysql> SELECT CONVERT(right('1s23d45678', 7), SIGNED INTEGER);
+-------------------------------------------------+
| CONVERT(right('1s23d45678', 7), SIGNED INTEGER) |
+-------------------------------------------------+
| 3 |
+-------------------------------------------------+
1 row in set, 1 warning (0.00 sec)
mysql> SHOW WARNINGS;
+---------+------+----------------------------------------------+
| Level | Code | Message |
+---------+------+----------------------------------------------+
| Warning | 1292 | Truncated incorrect INTEGER value: '3d45678' |
+---------+------+----------------------------------------------+
1 row in set (0.00 sec)
Como dije, es una advertencia, no un error. Su consulta debería estar haciendo la actualización correctamente.
