convertir el resultado de mysql a json con los tipos correctos

El siguiente código es solo una prueba de concepto. Necesita encapsulación en una función/método y un poco de pulido antes de usarlo en producción (por ejemplo, llame a mysqli_fetch_field() en un bucle y almacena los objetos que devuelve antes de procesar cualquier fila, no una vez por cada fila).

Utiliza la función mysqli_fetch_field() para obtener información sobre cada columna del conjunto de resultados y convierte en números aquellas columnas que tienen tipos numéricos. Los valores de MYSQLI_TYPE_* Las constantes se pueden encontrar en la página de documentación de Constantes predefinidas de Mysqli .

// Get the data
$result = mysqli_query($db, "SELECT * FROM table WHERE id=1");
$row    = mysqli_fetch_assoc($result);

// Fix the types    
$fixed = array();
foreach ($row as $key => $value) {
    $info = mysqli_fetch_field($result);
    if (in_array($info->type, array(
            MYSQLI_TYPE_TINY, MYSQLI_TYPE_SHORT, MYSQLI_TYPE_INT24,    
            MYSQLI_TYPE_LONG, MYSQLI_TYPE_LONGLONG,
            MYSQLI_TYPE_DECIMAL, 
            MYSQLI_TYPE_FLOAT, MYSQLI_TYPE_DOUBLE
    ))) {
        $fixed[$key] = 0 + $value;
    } else {
        $fixed[$key] = $value;
    }
}

// Compare the results
echo('all strings: '.json_encode($row)."\n");
echo('fixed types: '.json_encode($fixed)."\n");