Haz esto:
UPDATE newspapers
SET scan_notes = "data",
scan_entered_by = "some_name",
scan_modified_date = "current_unix_timestamp",
scan_created_date = COALESCE(scan_created_date, "current_unix_timestamp")
WHERE id = X
El COALESCE
la función elige el primer valor no nulo. En este caso, actualizará la marca de fecha scan_created_date para que tenga el mismo valor si existe; de lo contrario, tomará lo que sea que reemplace "current_unix_timestamp"
con.