Suponiendo que no haya problemas de clave externa con los que lidiar, este código lo hará:
set @id:=0;
update mytable
set id = (@id := @id + 1)
order by id;
Si hay problemas de clave externa, asegúrese de que sus restricciones estén definidas así antes ejecutas la actualización:
ALTER CHILD_TABLE ADD CONSTRAINT
FOREIGN KEY MYTABLE_ID REFERENCES MYTABLE
ON UPDATE CASCADE; -- This is the important bit
Cuando todo esté listo, ejecute esto para arreglar el valor de auto_incremento:
SELECT MAX(ID) + 1 FROM MYTABLE; -- note the output
ALTER TABLE MYTABLE AUTO_INCREMENT = <result from above>;
