Puede que esto no sea exactamente sobre el tema (ya que estoy usando repositorios de SpringData), pero cuando estaba buscando la respuesta a mi problema, terminé aquí, por lo que esto puede ayudar a la siguiente persona.
lo siguiente y mi campo de versión no se devolvía actualizado.
savedJpa = repository.save(updateJpa);
Al final mi solución fue
savedJpa = repository.saveAndFlush(updateJpa);
