No hay diferencia, asumiendo una cantidad constante de datos.
Probablemente una ganancia en términos prácticos debido a cosas como ventanas de mantenimiento reducidas (reconstrucciones de índices más pequeñas), la capacidad de tener grupos de archivos de solo lectura, etc.
El rendimiento lo determinan las consultas y los índices (en el nivel más básico):no el número de objetos