reemplazar esta sección:
$result=array();
while($row=mysqli_fetch_array($res)){
array_push($result,array('id'=>$row[0],'timeIn'=>$row[1],'timeOut'=>$row[2]));
}
echo (json_encode(array("result"=>$result)));
con:
echo json_encode($res);
creas muchas matrices, cuando haces push in while loop, empujas la matriz en la matriz $result, luego, cuando haces eco, colocas todos los resultados en otra matriz. y esto es más complejo.