Una forma sencilla de hacerlo es agregarlo a la ruta del entorno de Windows (se encuentra en la ruta en la mayoría de los sistemas Unix). Entonces solo tienes que llamar a mysql desde el script.
Aquí está la página de información sobre cómo hacerlo desde MySQL:Inicio del servicio de Windows MySQL
Y en esa página quieres encontrar el texto
y lea esa sección. Usando este método, solo tiene que llamar a mysql sin una ruta.