El problema parecía estar en el archivo de configuración phpmyadmin de MySQL PersistentConnections establecido en FALSE lo que resultó en un nuevo CONNECTION_ID cada vez que se emitió una consulta, por lo tanto, representando SELECT LAST_INSERT_ID() ineficaz.
más información en el tema siguiente Cada consulta crea una nueva CONEXIÓN_ID()
También gracias dnagirl por ayuda
