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Django:los modelos no existen, pero Django aún los carga

Es muy probable que esto se deba a que tiene un archivo models.pyc perdido en alguna parte. Borre todos los archivos *.pyc. Puedes probar algo como esto si estás en Linux:

find . -name '*pyc' -exec 'rm' '{}' ';'

Siga eso por ./manage.py makemigrations apihandlers y luego ./manage.py migrate