Tamaño de la memoria virtual y el tamaño del residente parecerá muy grande para el proceso mongod. Esto es benigno:el espacio de la memoria virtual será un poco más grande que el tamaño de los archivos de datos abiertos y asignados; el tamaño residente variará según la cantidad de memoria que no utilicen otros procesos en la máquina.
http://www.mongodb.org/display/DOCS/Caching
Cuando elimina un objeto de la colección MongoDB, el espacio que ocupaba no se recolecta automáticamente como basura y los nuevos registros solo se agregan al final de los archivos de datos, haciéndolos crecer más y más. Esto lo explica todo:
http://www.mongodb.org/display/DOCS/Excessive+Disk+Space
Para empezar, simplemente use:
db.repairDatabase()
