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Conversión de tipos de datos en MongoDB

Puede hacer esto con $concat pero primero debe convertir a una cadena a través de $substr , también manejando el caso de dos dígitos:

db.Document.aggregate([ 
    { "$group": { 
        "_id":{ 
            "$concat": [
                 { "$substr": [ { "$year": "$CreationDate" }, 0, 4 ] },
                 "-",
                 { "$cond": [
                     { "$gt": [ { "$month": "$CreationDate" }, 9 ] },
                     { "$substr": [ { "$month": "$CreationDate" }, 0, 2 ] },
                     { "$concat": [
                         "0",
                         { "$substr": [ { "$month": "$CreationDate" }, 0, 1 ] },
                     ]},
                 ]},
                 "-",
                 { "$cond": [
                     { "$gt": [ { "$dayOfMonth": "$CreationDate" }, 9 ] },
                     { "$substr": [ { "$dayOfMonth": "$CreationDate" }, 0, 2 ] },
                     { "$concat": [
                         "0",
                         { "$substr": [ { "$dayOfMonth": "$CreationDate" }, 0, 1 ] },
                     ]}
                 ]}
             ]
         },
         { "cnt": { "$sum": 1 } }
    }}
    { "$sort":{ "cnt" :-1 }}
]);

Posiblemente, mejor es simplemente usar matemáticas de fecha en su lugar, esto devuelve un valor de marca de tiempo de época, pero es fácil trabajar en un objeto de fecha en el procesamiento posterior:

db.Document.aggregate([
    { "$group": {
        "_id": {
            "$subtract": [
                { "$subtract": [ "$CreationDate", new Date("1970-01-01") ] },
                { "$mod": [
                    { "$subtract": [ "$CreationDate", new Date("1970-01-01") ] },
                    1000 * 60 * 60 * 24
                ]}
            ]
        },
        "cnt": { "$sum": 1 }
    }},
    { "$sort": { "cnt": -1 } }
])