Cambie la estructura del documento en mongodb con mongo Shell

Si no le gusta la agregación (o su content el contenido de puede diferir entre documentos) también puede usar

 db.coll.find().forEach(function (d) {
    db.coll.update({
        _id : d._id
    }, {
        $set : d.content,
        $unset : {
            'content' : 1
        }
    })
});