Actualmente está intentando actualizar en función de una cadena, no de un ObjectId.
Asegúrese de inicializar un nuevo ObjectId de la cadena cuando construya su consulta:
mongoDB.getCollection("restaurants").updateOne(
new BasicDBObject("_id", new ObjectId("56110fe1f882142d842b2a63")),
new BasicDBObject("$set", new BasicDBObject("zipcode", "10462"))
);