En lugar de simplemente registrar las publicaciones que le gustan a un usuario con:
Meteor.users.update({ _id: this.userId },{ $addToSet: { liked: postId }});
Empuje un objeto que incluya tanto el postId y fecha actual
Meteor.users.update({ _id: this.userId },
{ $push: { liked: { postId: postId, likedAt: new Date() }});
Eso resuelve su pregunta de "dónde almacenar", pero complica su vida de otras maneras porque su consulta de búsqueda/clasificación será más complicada. También deberá evitar duplicados con el código porque mientras $addToSet
lo hace automáticamente $push
no lo hace.