Spring MongoDB Repository funciona solo en algunos casos

Como mlk mencionado, el problema fue con mi implementación de singleton que causó un problema en el contenedor de primavera. Cambié el código de DataMapsFactory a:

package com.njugroup.flotilla.domain.factories;

import com.njugroup.flotilla.domain.maps.TermsMap;
import com.njugroup.flotilla.repository.TermsMapRepository;
import org.slf4j.Logger;
import org.slf4j.LoggerFactory;
import org.springframework.beans.factory.annotation.Autowired;
import org.springframework.stereotype.Component;

import java.util.Optional;

@Component
public class DataMapsFactory{

    private final Logger log = LoggerFactory.getLogger(TermsMapsFactory.class);

    @Autowired
    private TermsMapRepository termsMapRepository;

    public TermsMap getDataMapForVehicle(String id) {
        log.debug("Getting data map for: "+id);
        try {
            Optional<TermsMap> map = Optional.ofNullable(termsMapRepository.findOneByEntityId(id));
            log.debug("fetched map: "+map);
            return map.get();
        } catch (Exception e) {
            e.printStackTrace();
            return null;

        }
    }
}

Ahora funciona de maravilla.