Obtener un solo objeto de mongodb en C#

Sí, lo hay.

En primer lugar, no use FindAsync , usa Find en cambio. En el IFindFluent resultado use el SingleAsync método de extensión y espera la tarea devuelta dentro de un método asíncrono:

async Task MainAsync()
{
    IMongoCollection<ApplicationUser> userCollection = ...;

    var applicationUser = await userCollection.Find(_ => _.Id == inputId).SingleAsync();
}

El nuevo controlador usa async-await exclusivamente. No lo bloquees usando Task.Result .