Tienes que llamar y await CreateOneAsync con una IndexKeysDefinition obtienes usando Builders.IndexKeys :
static async Task CreateIndex()
{
var client = new MongoClient();
var database = client.GetDatabase("db");
var collection = database.GetCollection<Hamster>("collection");
await collection.Indexes.CreateOneAsync(Builders<Hamster>.IndexKeys.Ascending(_ => _.Name));
}
Si no tienes un Hamster también puede crear el índice de una manera no fuertemente tipada especificando la representación json del índice:
await collection.Indexes.CreateOneAsync("{ Name: 1 }");