safe=true
no es una especificación de índice.
En versiones anteriores de MongoDB, anteriores a la 3.4, se pueden agregar especificaciones de índices adicionales. Esos fueron utilizados por conductores específicos.
En 3.4, mongodb agregó una validación en la especificación de índices:
Es por eso que tiene este error. Me temo que debe asegurarse de que el índice en su versión 3.2 no tenga especificaciones de índice no válidas, y luego haga el mongodump.
Como dice kz_sergey en su respuesta, puede mongorestore
usando --noIndexRestore
, eso debería funcionar bien.