Error de nombre de columna no válido al llamar a insertar después de crear la tabla

SQL Server intenta compilar todo el lote. Si la tabla ya existe, se compilará de acuerdo con la definición preexistente. La declaración que hace referencia a las nuevas columnas no se compila y, por lo tanto, el lote nunca se ejecuta.

Debe agrupar las declaraciones utilizando la nueva definición en un nuevo lote. Si está ejecutando esto en SSMS, simplemente inserte un GO

USE MyDatabase;

BEGIN TRANSACTION;

-- some statements

PRINT(N'#1');

IF (EXISTS (SELECT * FROM INFORMATION_SCHEMA.COLUMNS WHERE TABLE_SCHEMA = N'dbo' AND TABLE_NAME = N'Table1' AND COLUMN_NAME = 'Table2_Id'))
BEGIN
    ALTER TABLE [dbo].[Table1] DROP CONSTRAINT [FK_Table1_Table2_Table2_Id];
    ALTER TABLE [dbo].[Table1] DROP COLUMN [Table2_Id];
    DROP TABLE [dbo].[Table2];

    PRINT(N'Table2 was dropped.');
END

GO

PRINT(N'#2');

IF (NOT EXISTS (SELECT * FROM INFORMATION_SCHEMA.TABLES WHERE TABLE_SCHEMA = N'dbo' AND TABLE_NAME = N'Table2'))
BEGIN
    CREATE TABLE [dbo].[Table2]
    (
        [Id] INT NOT NULL PRIMARY KEY IDENTITY,
        [Number] INT NOT NULL UNIQUE,
        [Name] NVARCHAR(200) NOT NULL,
        [RowVersion] TIMESTAMP NOT NULL
    );
PRINT(N'Table2 was re-created.');
    INSERT INTO [dbo].[Table2]([Number], [Name]) VALUES(-1, N'Default value');
PRINT(N'Default value was inserted in Table2.');
END

COMMIT

De lo contrario, podría ejecutar la línea infractora en un lote secundario

    EXEC(N'INSERT INTO [dbo].[Table2]([Number], [Name]) VALUES(-1, N''Default value'');')