No se puede usar el nombre de alias en la cláusula WHERE pero sí en ORDER BY

Esto sucede debido al orden natural de procesamiento de consultas, que es el siguiente:

1. FROM
2. ON
3. OUTER
4. WHERE
5. GROUP BY
6. CUBE | ROLLUP
7. HAVING
8. SELECT
9. DISTINCT
10. ORDER BY
11. TOP

Estás asignando tu alias en SELECT declaración. Como puedes ver WHERE se procesa antes de SELECT y ORDER BY viene después de eso. Esa es la razón. Ahora, ¿cuáles son las soluciones alternativas:

• Subconsultas. Pero pueden ser difíciles de leer.
• CROSS APPLY . Esto debería embellecer su código un poco y es el método recomendado.

CROSS APPLY asignará un alias antes de WHERE declaración, haciéndola utilizable en ella.

SELECT [Hotel Id]
    , latitude
    , longitude
    , establishmentname
    , Distance
FROM [dbo].[RPT_hotels]
CROSS APPLY (
    SELECT 6371 * ACos(Cos(RADIANS(Latitude)) * Cos(RADIANS('50.017466977673905')) * Cos(RADIANS('24.69924272460935') - RADIANS(Longitude)) + Sin(RADIANS(Latitude)) * Sin(RADIANS('50.017466977673905')))
    ) AS T(Distance)
WHERE distance < 30
ORDER BY Distance;

Si quieres saber más. Lea esta pregunta: ¿Cuál es el orden de ejecución de esta instrucción SQL?