Genere un número aleatorio que no está en una tabla en el servidor sql

Otra opción más, siempre me ha gustado NEWID() para pedidos aleatorios, y las uniones cruzadas crean muchas filas de manera muy eficiente:

;with cte AS (SELECT 1 n UNION ALL SELECT 1)
     ,cte2 AS (SELECT TOP 100 ROW_NUMBER() OVER(ORDER BY a.n) n
               FROM cte a,cte b,cte c,cte d, cte e, cte f, cte g)
SELECT TOP 1 n
FROM cte2 a
WHERE NOT EXISTS (SELECT 1
                  FROM randomNums b
                  WHERE a.n = b.num)
ORDER BY NEWID()

Demostración:SQL Fiddle