¿Por qué falla la declaración CREATE PROCEDURE cuando la uso con la declaración IF aquí?

Agregar IR después de tu IF declaración muestra que este es el final de su primer lote de consultas.

Lea más aquí:

http://msdn.microsoft.com/en-us/library/ms188037 .aspx

IF OBJECT_ID('[dbo].[myStoredProc]') IS not NULL
    DROP PROCEDURE dbo.myStoredProc
GO

Esto evitará que ocurra su error.