Si desea leer datos de dos hojas y mezclarlos para crear registros "combinados" que ingresa en la base de datos donde tiene configurado el FK, entonces debería ser posible.
Lea Lectura de celdas de Excel con C#
Puede abrir las hojas de identidad a las que accede en un bucle, pero tendrá que coordinar la creación de datos desde sus hojas.
