El prefijo JNDI es java:comp/env/ para Tomcat
, entonces en tu caso es
jndiName = "java:comp/env/mydatasource"
en DataSource.groovy .
Para la referencia:Grails Docs .
Editar:Su Config.groovy también falta el driverClassName propiedad. Yo pienso
es
driverClassName: "oracle.jdbc.driver.OracleDriver",
