Compruebe el método dbWriteTable
del paquete RJDBC
Aquí un ejemplo
dbWriteTable(jdbcConnection,"TABLE_NAME",data.frame.name., rownames=FALSE, overwrite = TRUE, append = FALSE)
Ajuste las opciones según sea necesario. Para sobrescribir VERDADERO, se crea una nueva tabla en el esquema de su usuario de conexión.