Aparentemente, para que la versión 5.1.33 del controlador MySQL JDBC funcione con la zona horaria UTC, se debe especificar el serverTimezone explícitamente en la cadena de conexión.
jdbc:mysql://localhost/db?useUnicode=true&useJDBCCompliantTimezoneShift=true&useLegacyDatetimeCode=false&serverTimezone=UTC
