$query = "ALTER TABLE `" . $table_prefix . "posts_to_bookmark`
ADD COLUMN `ping_status` INT(1) NOT NULL
AFTER `<TABLE COLUMN BEFORE THIS COLUMN>`";
Creo que necesitas tener ADD COLUMN y usa AFTER , no BEFORE .
En caso de que quiera colocar una columna al principio de una tabla, use el FIRST declaración:
$query = "ALTER TABLE `" . $table_prefix . "posts_to_bookmark`
ADD COLUMN `ping_status` INT(1) NOT NULL
FIRST";
https://dev.mysql.com/doc/refman /5.1/es/alter-table.html