Parece que estás en Windows:el error ENFILE básicamente dice que tienes demasiados archivos abiertos. No estoy muy seguro de cómo se soluciona exactamente:en general, está en algún lugar entre 512 y 2048 en proceso .
Sugeriría tal vez mover todos los archivos fuera del directorio de datos de MySQL e intentar recuperarlos uno por uno.