MySQL:busque la palabra exacta de la cadena

Intenta usar expresiones regulares:

SELECT 
    *
FROM
    `table`
WHERE
    Description regexp '(^|[[:space:]])pen([[:space:]]|$)';

Demostración

O usando límites de palabras :

SELECT 
    *
FROM
    `table`
WHERE
    Description regexp '[[:<:]]pen[[:>:]]';