Usualmente uso el archivo de propiedades para crear automáticamente una base de datos cuando estoy usando Spring, y a continuación se muestra cómo se hace, espero que esto funcione, así que modificará esto para satisfacer sus necesidades...
database.driver=com.mysql.jdbc.Driver
database.url=jdbc:mysql://localhost:3306/userdb?createDatabaseIfNotExist=true
database.user=root
database.password=root
hibernate.dialect=org.hibernate.dialect.MySQLDialect
hibernate.show_sql=true
hibernate.hbm2ddl.auto=create
