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Cifrado del tráfico de MySQL en secuencias de comandos

Si se conecta a MySQL mediante SSL, todo el tráfico entre su cliente SSL y el servidor se cifrará.

MYSQL_CLIENT_SSL está obsoleto. Usando mysqli si necesita usar SSL,

$db = mysqli_init(); 
$db->ssl_set(null, null,'cacert.pem',NULL,NULL); 
$db->real_connect('host','user','pass','db');