El sistema generará un proceso secundario para ejecutar un comando de shell...
El directorio de trabajo actual es una propiedad de nivel de proceso... por lo que no puede cambiarlo en el proceso principal desde un proceso secundario. Por eso no funciona.
Escaneé brevemente los documentos de MySQL en http://dev. mysql.com/doc/refman/5.5/en/mysql-commands.html pero no vi un comando de CD directo que cambie el directorio de trabajo. Creo que una persona aventurera podría escribir uno....
