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MySQL Workbench - ¿Es el esquema lo mismo que la base de datos?

Sí, en MySQL, esquema y base de datos son sinónimos. Esto incluso se extiende a la sintaxis:

CREATE DATABASE foo;
DROP SCHEMA foo;

CREATE SCHEMA bar;
DROP DATABASE bar;

Tanto un esquema como una base de datos son básicamente un espacio de nombres para tablas.

En algunas otras implementaciones de SQL, los términos base de datos y esquema se usan de manera diferente.