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MySQL DONDE `character` ='a' coincide con a, A, Ã, etc. ¿Por qué?

Como se documenta en Conjuntos de caracteres Unicode :

El cuadro de clasificación completo deja en claro que, en esta colación, la mayoría de las variaciones de una letra base son equivalentes independientemente de su tipo de letra o acento/decoración.

Si solo desea hacer coincidir letras exactas, debe usar una intercalación binaria como utf8_bin .