¿Por qué NHibernate no admite el procesamiento por lotes en MySql?

Es la respuesta correcta.

El parche que usa una referencia a MySql.Data no entrará en el tronco en su forma actual debido a las razones mencionadas por Rippo.

Sin embargo, no necesita compilar NH con el parche. Simplemente puede inyectar el nuevo Batcher.

Es tan fácil como:

config.DataBaseIntegration(
       db => db.Batcher<MySqlClientBatchingBatcherFactory>());