mysql_real_escape_string no es lo suficientemente bueno?

Razonamiento a partir del nombre del método queryAsArray , parece que estás usando esta DbBase clase de los comentarios de la página del manual de funciones de MySQL . Si es así, es la query método que elimina el carácter de escape de las comillas escapadas:

function query($sql, &$records = null){
    $sql = str_replace(array('\\"', "\\'"), array('"', "'"), $sql);
    // …
}

Entonces no es un milagro que tu ejemplo funcione (lo simplifiqué):

$input = "', BAD SQL INJECTION --";

$sql = "SELECT '".mysql_real_escape_string($input)."'";
var_dump($sql);  // string(33) "SELECT '\', BAD SQL INJECTION --'"
//                      everything’s OK ↑

$sql = str_replace(array('\\"', "\\'"), array('"', "'"), $sql);
var_dump($sql);  // string(32) "SELECT '', BAD SQL INJECTION --'"
//                                Oops! ↑