Todas las opciones en su my.cnf deben estar dentro de un "grupo" como:
[mysqld]
bind-address 127.0.0.1
El grupo en este ejemplo es "mysqld". El grupo se nombra con una línea que precede a las opciones y el nombre del grupo está entre corchetes.
Su archivo no tiene ningún identificador de grupo nombrado antes de que comience a dar opciones.
Lea https://dev.mysql.com/doc/ refman/5.7/en/option-files.html para obtener más detalles sobre cómo dar formato a los archivos de opciones de MySQL.