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MySQL:¿Cuenta dos cosas en una consulta?

Puede agrupar sus registros por su columna booleana y obtener el recuento de cada grupo.

 SELECT bool_column, COUNT(bool_column) FROM your_table
 WHERE your_conditions
 GROUP BY bool_column

Obviamente, esto funcionará no solo para columnas booleanas sino también con otros tipos de datos si lo necesita.