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¿Cómo debo manejar los pesos de las entradas duplicadas en el índice de búsqueda de MyISAM?

Parece que ejecutó myisam_ftdump -d . Creo que quieres usar myisam_ftdump -c en su lugar.

Eso le dará una fila por palabra, junto con un recuento de cuántas veces aparece esa palabra en el índice y su peso global.

Aquí está el documento sobre -c vs. -d:

  -c, --count         Calculate per-word stats (counts and global weights).
  -d, --dump          Dump index (incl. data offsets and word weights).