Mysql Inner Join and Group Repitiendo la fila

Asumiendo report a users es un 1:1 relación, entonces debería poder resolver su problema agregando comentarios en una tabla derivada y uniéndose a eso en su lugar:

SELECT report.text, 
       Json_arrayagg(Json_object('display_name', users.display_name, 'photo_url' 
                     , 
                     users.photo_url))                       AS USER,
       rc.COMMENTS
FROM   report 
INNER JOIN users ON users.id = report.user_id 
LEFT JOIN (
  SELECT report_id,
         Json_arrayagg(Json_object('text', report_comments.text, 'display_name', 
                                   report_comments.user_id)) AS COMMENTS
  FROM report_comments 
  GROUP BY report_id
) rc ON rc.report_id = report.id 
WHERE  report.user_id = :userId 
GROUP  BY report.id 

Si un informe puede tener varios usuarios, deberá agregar la información del usuario en una tabla derivada de la misma manera.